A FIDENE tem sua história marcada pela presença ativa na região. Primeiro, através do Movimento Comunitário de Base, na década de 60. Depois, nos anos 70, pela estruturação do Instituto de Educação Permanente – IEP e do Instituto de Pesquisa e Planejamento – IPP. Nos anos 80, esta ação ocorre através do Movimento para o Desenvolvimento Regional – MDR.

Dez anos mais tarde, na década de 90, através da Coordenadoria de Serviços à Região, criam-se as condições para a constituição do Instituto de Políticas Públicas e Desenvolvimento Regional – IPD, que significa mais um passo na consolidação do compromisso da Fundação com a sociedade regional.

Em 1999, o Instituto passa por um processo de avaliação, que culmina com a aprovação, pelo Conselho Diretor da FIDENE, a Resolução 02/99, de 31/05/1999, que Regulamenta a Organização e o Funcionamento do IPD.

Neste período o IPD marca sua história com a presença ativa na região, através da prestação de assessorias e serviços técnicos, da qualificação e capacitação de recursos humanos. Formando uma equipe qualificada e habilitada em áreas específicas, o IPD consolidou-se como parceiro da comunidade para atender às demandas de integração e desenvolvimento regional.

O Instituto atua ainda em parceria com os Conselhos Regionais de Desenvolvimento do Noroeste Colonial – COREDE/NORC e Fronteira Noroeste – COREDE/FN, compartilhando estruturas físicas e de pessoal, a fim da realização de um trabalho em conjunto, visando o desenvolvimento regional, através da elaboração, execução e acompanhamento de projetos, estimulando o processo de inovação através dos Pólos de Modernização Tecnológica da região.

As comemorações dos 10 anos de atuação do IPD acontecem em 2006, quando o Instituto aproxima-se ainda mais da comunidade, através da transferência de suas instalações para o centro de Ijuí, abrigando os Núcleo de Gestão Pública, Qualificação, Desenvolvimento Regional e Consultorias, estrutura do COREDE/NORC, além dos programas Extensão Empresarial e Redes de Cooperação, desenvolvidos em parceria com a Secretaria do Desenvolvimento e dos Assuntos Internacionais – SEDAI.